z230
This commit is contained in:
@@ -10,18 +10,67 @@ z eRecept SÚKL API a jejich uložení do relační databáze MySQL.
|
||||
| Soubor | Co dělá |
|
||||
|--------|---------|
|
||||
| `05UlozitOdpoved.py` | Stáhne XML pro **jednoho** pacienta (ruční test/ladění) |
|
||||
| `06UlozitDoMySQL.py` | DDL schématu, parsování XML, import do MySQL — používá se jako knihovna i samostatně |
|
||||
| `06UlozitDoMySQL.py` | DDL schématu, parsování XML, import do MySQL — používá se jako **knihovna**, ne spouštět přímo! |
|
||||
| `07StahnoutVsechny.py` | **Hlavní skript** — načte pacienty z Medicusu, stáhne lékové záznamy, uloží XML i DB záznamy |
|
||||
| `reimport_z_xml.py` | Reimport XML ze zálohy bez volání API — viz sekce níže |
|
||||
|
||||
```
|
||||
LékovýZáznamWithClaude/
|
||||
├── 05UlozitOdpoved.py
|
||||
├── 06UlozitDoMySQL.py
|
||||
├── 07StahnoutVsechny.py
|
||||
├── LEKOVY_ZAZNAM_DB.md
|
||||
├── Logs/ ← log každého běhu (UTF-8, YYYY-MM-DD_HH-MM-SS.log)
|
||||
├── Tests/ ← starší vývojové skripty
|
||||
└── xml_archive/ ← archiv XML odpovědí (YYYY-MM-DD/Prijmeni_Jmena_datnar.xml)
|
||||
recept/
|
||||
├── setup.ps1 ← vytvoří .venv, nainstaluje závislosti, Playwright chromium
|
||||
├── requirements.txt ← seznam Python závislostí
|
||||
├── .venv/ ← virtuální prostředí (Python 3.x)
|
||||
│
|
||||
├── LékovýZáznamWithClaude/
|
||||
│ ├── 05UlozitOdpoved.py
|
||||
│ ├── 06UlozitDoMySQL.py
|
||||
│ ├── 07StahnoutVsechny.py
|
||||
│ ├── reimport_z_xml.py
|
||||
│ ├── LEKOVY_ZAZNAM_DB.md ← tento soubor
|
||||
│ ├── Logs/ ← log každého běhu (UTF-8, YYYY-MM-DD_HH-MM-SS.log)
|
||||
│ ├── Tests/ ← starší vývojové skripty
|
||||
│ └── xml_archive/ ← archiv XML odpovědí (YYYY-MM-DD/Prijmeni_Jmena_datnar.xml)
|
||||
│
|
||||
└── Dotazy/
|
||||
├── prehled_pacienta.py ← konzolový přehled pacienta
|
||||
├── prehled_pacienta_excel.py ← export přehledu pacienta do Excelu
|
||||
└── DOTAZY.md ← dokumentace dotazovacích skriptů
|
||||
```
|
||||
|
||||
> **⚠️ NIKDY nespouštět `06UlozitDoMySQL.py` přímo** — zavolá `vytvor_schema()`,
|
||||
> která provede `DROP TABLE` a smaže celou databázi.
|
||||
> Pro import dat vždy použít `07StahnoutVsechny.py` nebo `reimport_z_xml.py`.
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
## Nastavení prostředí (jednorázově)
|
||||
|
||||
```powershell
|
||||
# PowerShell — spustit jednou po naklonování projektu
|
||||
cd U:\recept
|
||||
.\setup.ps1
|
||||
```
|
||||
|
||||
`setup.ps1` provede:
|
||||
1. Vytvoří `.venv` s Python interpretem z `C:\Python\python.exe`
|
||||
2. Nainstaluje všechny závislosti z `requirements.txt`
|
||||
3. Nainstaluje Playwright Chromium (pro případné automatizace)
|
||||
|
||||
Po nastavení aktivace:
|
||||
```powershell
|
||||
.venv\Scripts\Activate.ps1
|
||||
```
|
||||
|
||||
### requirements.txt
|
||||
|
||||
```
|
||||
requests
|
||||
requests-pkcs12
|
||||
pymysql
|
||||
fdb
|
||||
zeep
|
||||
mysql-connector-python
|
||||
playwright
|
||||
openpyxl
|
||||
```
|
||||
|
||||
---
|
||||
@@ -29,9 +78,6 @@ LékovýZáznamWithClaude/
|
||||
## Typické spuštění
|
||||
|
||||
```bash
|
||||
# Čistý start — jednou (DROP + CREATE schéma, importuje odpoved_lekovy_zaznam.xml)
|
||||
python 06UlozitDoMySQL.py
|
||||
|
||||
# Hromadné stažení všech registrovaných pacientů
|
||||
python 07StahnoutVsechny.py
|
||||
|
||||
@@ -40,6 +86,9 @@ python 07StahnoutVsechny.py --prijmeni Buzalka,Buzalková,Kusinová
|
||||
|
||||
# Dávkování po částech
|
||||
python 07StahnoutVsechny.py --offset 100 --limit 50
|
||||
|
||||
# Reimport ze zálohy XML (bez volání API) — viz níže
|
||||
python reimport_z_xml.py
|
||||
```
|
||||
|
||||
---
|
||||
@@ -275,7 +324,7 @@ Lékaři, kteří pacientovi předepisovali (ze všech ordinací).
|
||||
| `prijmeni` | VARCHAR(35) | |
|
||||
| `jmena` | VARCHAR(24) | |
|
||||
| `icz` | CHAR(8) | IČZ zdravotnického zařízení |
|
||||
| `icp` | CHAR(8) | IČP pracoviště |
|
||||
| `icp` | CHAR(8) | IČP pracoviště — **poslední 3 číslice = kód odbornosti** (001 = prakt. lékař, 272 = alergologie…) |
|
||||
| `pzs_nazev` | VARCHAR(200) | název zdravotnického zařízení |
|
||||
| `ulice` | VARCHAR(150) | |
|
||||
| `mesto` | VARCHAR(100) | |
|
||||
@@ -374,10 +423,96 @@ SELECT prijmeni, jmena, datum_narozeni, poznamka
|
||||
FROM pacient
|
||||
WHERE poznamka IS NOT NULL
|
||||
ORDER BY prijmeni;
|
||||
|
||||
-- lékaři dle odbornosti — kolik předpisů pochází od které speciality
|
||||
SELECT RIGHT(pr.icp, 3) AS odb_kod, COUNT(*) AS pocet_predpisu
|
||||
FROM predpis p
|
||||
JOIN predepisujici pr ON pr.lekar_kod = p.kod_predepisujiciho
|
||||
WHERE pr.icp IS NOT NULL
|
||||
GROUP BY RIGHT(pr.icp, 3)
|
||||
ORDER BY pocet_predpisu DESC;
|
||||
|
||||
-- lékový záznam pacienta dle rodného čísla (přes Firebird → MySQL)
|
||||
-- krok 1: z Medicusu zjistit příjmení a datum narozeni pro RC 7309208104
|
||||
-- krok 2:
|
||||
SELECT pac.prijmeni, pac.jmena, pac.datum_narozeni,
|
||||
p.datum_vystaveni,
|
||||
COALESCE(v.nazev, p.nazev) AS vydany_lek,
|
||||
v.nazev IS NULL AS nevyzvednuto,
|
||||
p.atc, p.navod,
|
||||
pr.prijmeni AS lekar, RIGHT(pr.icp, 3) AS odb_kod
|
||||
FROM pacient pac
|
||||
JOIN zprava z ON z.pacient_id = pac.id
|
||||
JOIN predpis p ON p.zprava_id = z.id
|
||||
JOIN predepisujici pr ON pr.lekar_kod = p.kod_predepisujiciho
|
||||
LEFT JOIN vydej v ON v.id_lp_predpis = p.id_lp_predpis
|
||||
WHERE pac.prijmeni = 'Buzalka' AND pac.datum_narozeni = '1973-09-20'
|
||||
ORDER BY p.datum_vystaveni DESC;
|
||||
```
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
## Reimport ze zálohy XML (`reimport_z_xml.py`)
|
||||
|
||||
Slouží k opětovnému naplnění MySQL databáze z lokálních XML souborů **bez volání eRecept API**.
|
||||
Použití: obnova po neúmyslném smazání databáze, migrace na nový server, re-parsování při změně schématu.
|
||||
|
||||
### Jak funguje
|
||||
|
||||
1. Načte všechny registrované pacienty z Firebirdu (ICP `09305001`, odbornost `001`)
|
||||
2. Pro každý XML soubor v archivu:
|
||||
- Naparsuje XML (volá `parsuj_xml()` z `06UlozitDoMySQL.py`)
|
||||
- Dohledá pacienta v Firebirdu dle příjmení + data narození z XML
|
||||
- Pokud je registrovaný → `upsert` pacienta do MySQL (INSERT ON DUPLICATE KEY UPDATE)
|
||||
- Zavolá `uloz()` — INSERT IGNORE, takže duplicity se ignorují
|
||||
3. Výpis průběhu: `[ 1/1177] Buzalka_Vladimir_1973-09-20.xml OK 12p 18v`
|
||||
|
||||
### Spuštění
|
||||
|
||||
```bash
|
||||
# Výchozí adresář: xml_archive/2026-04-11
|
||||
python reimport_z_xml.py
|
||||
|
||||
# Konkrétní podadresář
|
||||
python reimport_z_xml.py xml_archive/2026-04-11
|
||||
|
||||
# Celý archiv rekurzivně (všechna data)
|
||||
python reimport_z_xml.py xml_archive
|
||||
```
|
||||
|
||||
### Konfigurace v souboru
|
||||
|
||||
```python
|
||||
XML_ADRESAR = Path(__file__).parent / "xml_archive" / "2026-04-11" # výchozí adresář
|
||||
ICP = "09305001" # IČP ordinace pro filtr registrovaných pacientů
|
||||
ODB = "001" # odbornost (001 = praktický lékař)
|
||||
```
|
||||
|
||||
### Poznámky
|
||||
|
||||
- Pacienti, kteří nejsou v Firebirdu registrováni pod daným ICP/ODB, se přeskočí
|
||||
(pokud ale existují v MySQL z předchozího importu, data se aktualizují)
|
||||
- Firebird slouží jako autoritativní zdroj identit — `idpac` z KAR se propíše do MySQL `pacient.idpac`
|
||||
- `INSERT IGNORE` zajistí idempotentnost — opakované spuštění nepřidá duplikáty
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
## Dotazovací skripty (`Dotazy/`)
|
||||
|
||||
Viz samostatnou dokumentaci: [`Dotazy/DOTAZY.md`](../Dotazy/DOTAZY.md)
|
||||
|
||||
Stručný přehled:
|
||||
|
||||
| Skript | Co dělá |
|
||||
|--------|---------|
|
||||
| `prehled_pacienta.py` | Konzolový výpis lékového záznamu pacienta (lékaři + předpisy) |
|
||||
| `prehled_pacienta_excel.py` | Totéž, ale exportuje do formátovaného souboru Excel (.xlsx) |
|
||||
|
||||
Pacient se identifikuje **rodným číslem** (nastavení `RODNE_CISLO` v záhlaví skriptu).
|
||||
Oba skripty zobrazují **vydaný lék** (ne předepsaný), **odbornost lékaře** a příznak `*NV` pro nevyzvednuto.
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
## Závislosti (Python)
|
||||
|
||||
```
|
||||
@@ -385,10 +520,15 @@ requests
|
||||
requests-pkcs12
|
||||
pymysql
|
||||
fdb
|
||||
zeep
|
||||
mysql-connector-python
|
||||
playwright
|
||||
openpyxl
|
||||
```
|
||||
|
||||
```bash
|
||||
pip install requests requests-pkcs12 pymysql fdb
|
||||
# Instalace (nebo použít setup.ps1)
|
||||
pip install requests requests-pkcs12 pymysql fdb openpyxl
|
||||
```
|
||||
|
||||
---
|
||||
|
||||
Reference in New Issue
Block a user