notebookvb

This commit is contained in:
2026-04-06 21:37:25 +02:00
parent 401412daf0
commit 1f690810b3
2 changed files with 816 additions and 0 deletions
@@ -0,0 +1,523 @@
"""
Nacte odpoved lekoveho zaznamu (XML) a ulozi ji do MySQL.
Schema: zprava / predpis / predpis_slozka / vydej / vydej_slozka
Typy a delky presne dle XSD (Cuer2Schema.xsd + CuerSchema.xsd, verze 202501A)
Spusteni:
python 06UlozitDoMySQL.py
nebo:
python 06UlozitDoMySQL.py cesta/k/odpoved.xml
"""
import sys
from pathlib import Path
import xml.etree.ElementTree as ET
import pymysql
import pymysql.cursors
# ── konfigurace ───────────────────────────────────────────────────────────────
XML_SOUBOR = Path(__file__).parent / "odpoved_lekovy_zaznam.xml"
DB = dict(
host = "192.168.1.76",
user = "root",
password = "Vlado9674+",
database = "medicus",
charset = "utf8mb4",
cursorclass = pymysql.cursors.DictCursor,
)
NS = "http://www.sukl.cz/erp/201912"
# ─────────────────────────────────────────────────────────────────────────────
def t(el, tag):
"""Prvni potomek s danym tagem → text nebo None."""
found = el.find(f"{{{NS}}}{tag}")
return found.text.strip() if found is not None and found.text else None
def datum(s):
return s[:10] if s else None
def ts(s):
return s[:19].replace("T", " ") if s else None
# ── DDL ───────────────────────────────────────────────────────────────────────
DDL_TABULKY = [
# smazat v opacnem poradi kvuli FK
"DROP TABLE IF EXISTS predpis_slozka",
"DROP TABLE IF EXISTS vydej_slozka",
"DROP TABLE IF EXISTS vydej",
"DROP TABLE IF EXISTS predpis",
"DROP TABLE IF EXISTS zprava",
# ── zprava ────────────────────────────────────────────────────────────────
# zprava_odpoved_type + zprava_type:
# ID_Zpravy CHAR(36), Verze, Odeslano dateTime
# Aplikace(512), ID_Podani CHAR(36), Prijato dateTime
# jmeno_osoby_type: Prijmeni(35), Jmena(24)
"""
CREATE TABLE zprava (
id INT AUTO_INCREMENT PRIMARY KEY,
id_zpravy CHAR(36) NOT NULL UNIQUE,
verze VARCHAR(20),
odeslano DATETIME,
aplikace VARCHAR(512),
id_podani CHAR(36),
prijato DATETIME,
pacient_prijmeni VARCHAR(35),
pacient_jmena VARCHAR(24),
pacient_datum_narozeni DATE,
stazeno DATETIME DEFAULT CURRENT_TIMESTAMP,
INDEX idx_pacient (pacient_prijmeni, pacient_datum_narozeni)
) ENGINE=InnoDB
""",
# ── predpis ───────────────────────────────────────────────────────────────
# lz_nacteni_predepsany_lp_erp_type:
# ID_LP_Predpis CHAR(36) NOT NULL, KodPredepisujiciho(36) NOT NULL,
# DatumVystaveni date NOT NULL, Mnozstvi int(1-9999) NOT NULL,
# Navod(80) NOT NULL, Opakovani int?, ModryPruh boolean?
# lek — vzdy jen jeden z: HVLPReg / HVLPNereg / IPLP / INN
# hvlp_type: Kod CHAR(7)?, ATC(7)?, Nazev(146)!, Forma(27)?,
# Sila(24)?, CestaPodani(15)?, Baleni VARCHAR(22)?
# inn_predpis_type: Nazev(200) — nejdelsi nazev mezi typy
# iplp_predpis_type: PostupPripravy(4000), Nazev(146), CestaPodani(15), Forma(27)
"""
CREATE TABLE predpis (
id INT AUTO_INCREMENT PRIMARY KEY,
zprava_id INT NOT NULL,
id_lp_predpis CHAR(36) NOT NULL UNIQUE,
kod_predepisujiciho VARCHAR(36) NOT NULL,
datum_vystaveni DATE NOT NULL,
mnozstvi SMALLINT NOT NULL,
navod VARCHAR(80) NOT NULL,
opakovani INT,
modry_pruh TINYINT(1),
typ_leku ENUM('HVLPReg','HVLPNereg','IPLP','INN'),
lek_kod CHAR(7),
atc VARCHAR(7),
nazev VARCHAR(200),
forma VARCHAR(27),
sila VARCHAR(24),
cesta_podani VARCHAR(15),
baleni VARCHAR(22),
postup_pripravy VARCHAR(4000),
FOREIGN KEY (zprava_id) REFERENCES zprava(id) ON DELETE CASCADE,
INDEX idx_atc (atc),
INDEX idx_datum (datum_vystaveni)
) ENGINE=InnoDB
""",
# ── predpis_slozka ────────────────────────────────────────────────────────
# slozka_iplp_predpis_type:
# Mnozstvi DECIMAL(15,6) NOT NULL, Jednotka ENUM('g','ks') NOT NULL,
# Nazev(200) NOT NULL, Surovina CHAR(7)?, HVLPReg CHAR(7)?
"""
CREATE TABLE predpis_slozka (
id INT AUTO_INCREMENT PRIMARY KEY,
predpis_id INT NOT NULL,
mnozstvi DECIMAL(15,6) NOT NULL,
jednotka ENUM('g','ks') NOT NULL,
nazev VARCHAR(200) NOT NULL,
surovina CHAR(7),
hvlp_reg CHAR(7),
FOREIGN KEY (predpis_id) REFERENCES predpis(id) ON DELETE CASCADE,
INDEX idx_nazev (nazev)
) ENGINE=InnoDB
""",
# ── vydej ─────────────────────────────────────────────────────────────────
# lz_nacteni_vydany_lp_erp_type:
# Mnozstvi DECIMAL(6,2) NOT NULL, Navod(80) NOT NULL,
# Sarze(50) NOT NULL, SerioveCislo(20)?, Pozn(1000)?
# lek — vzdy jen jeden z: HVLPReg / HVLPNereg / IPLP
# iplp_type (vydej): KodVZP CHAR(7)?, PostupPripravy(4000), Nazev(146), CestaPodani(15)
"""
CREATE TABLE vydej (
id INT AUTO_INCREMENT PRIMARY KEY,
zprava_id INT NOT NULL,
id_lp_vydej CHAR(36) NOT NULL UNIQUE,
id_lp_predpis CHAR(36),
kod_vydavajiciho VARCHAR(36) NOT NULL,
datum_vydeje DATE NOT NULL,
mnozstvi DECIMAL(6,2) NOT NULL,
navod VARCHAR(80) NOT NULL,
exspirace DATE,
sarze VARCHAR(50) NOT NULL,
seriove_cislo VARCHAR(20),
pozn VARCHAR(1000),
typ_leku ENUM('HVLPReg','HVLPNereg','IPLP'),
lek_kod CHAR(7),
atc VARCHAR(7),
nazev VARCHAR(146),
forma VARCHAR(27),
sila VARCHAR(24),
cesta_podani VARCHAR(15),
postup_pripravy VARCHAR(4000),
FOREIGN KEY (zprava_id) REFERENCES zprava(id) ON DELETE CASCADE,
FOREIGN KEY (id_lp_predpis) REFERENCES predpis(id_lp_predpis) ON DELETE SET NULL,
INDEX idx_predpis (id_lp_predpis),
INDEX idx_atc (atc),
INDEX idx_datum (datum_vydeje)
) ENGINE=InnoDB
""",
# ── vydej_slozka ──────────────────────────────────────────────────────────
# slozka_iplp_type:
# Mnozstvi DECIMAL(15,6) NOT NULL, Jednotka ENUM('g','ks') NOT NULL,
# Nazev(200) NOT NULL, HrazenoZP DECIMAL(9,2)?,
# Surovina CHAR(7)?, HVLPReg CHAR(7)?
"""
CREATE TABLE vydej_slozka (
id INT AUTO_INCREMENT PRIMARY KEY,
vydej_id INT NOT NULL,
mnozstvi DECIMAL(15,6) NOT NULL,
jednotka ENUM('g','ks') NOT NULL,
nazev VARCHAR(200) NOT NULL,
hrazeno_zp DECIMAL(9,2),
surovina CHAR(7),
hvlp_reg CHAR(7),
FOREIGN KEY (vydej_id) REFERENCES vydej(id) ON DELETE CASCADE,
INDEX idx_nazev (nazev)
) ENGINE=InnoDB
""",
]
def vytvor_schema(conn):
with conn.cursor() as cur:
for stmt in DDL_TABULKY:
stmt = stmt.strip()
if stmt:
cur.execute(stmt)
conn.commit()
print("Schema OK (5 tabulek smazano a vytvoreno znovu)")
# ── parsovani leku ────────────────────────────────────────────────────────────
def parsuj_slozky_predpis(lek_el):
"""Ze IPLP elementu vraci seznam slovniku pro predpis_slozka."""
slozky = []
for s in lek_el.findall(f"{{{NS}}}Slozka"):
slozky.append(dict(
mnozstvi = t(s, "Mnozstvi"),
jednotka = t(s, "Jednotka"),
nazev = t(s, "Nazev"),
surovina = t(s, "Surovina"),
hvlp_reg = t(s, "HVLPReg"),
))
return slozky
def parsuj_slozky_vydej(lek_el):
"""Ze IPLP elementu vraci seznam slovniku pro vydej_slozka."""
slozky = []
for s in lek_el.findall(f"{{{NS}}}Slozka"):
slozky.append(dict(
mnozstvi = t(s, "Mnozstvi"),
jednotka = t(s, "Jednotka"),
nazev = t(s, "Nazev"),
hrazeno_zp = t(s, "HrazenoZP"),
surovina = t(s, "Surovina"),
hvlp_reg = t(s, "HVLPReg"),
))
return slozky
def parsuj_lek_predpis(p):
"""Vraci (lek_fields dict, slozky list).
Typ leku: HVLPReg / HVLPNereg / IPLP / INN — vzdy jen jeden.
"""
for typ in ("HVLPReg", "HVLPNereg"):
lek = p.find(f"{{{NS}}}{typ}")
if lek is not None:
return dict(
typ_leku = typ,
lek_kod = t(lek, "Kod"),
atc = t(lek, "ATC"),
nazev = t(lek, "Nazev"),
forma = t(lek, "Forma"),
sila = t(lek, "Sila"),
cesta_podani = t(lek, "CestaPodani"),
baleni = t(lek, "Baleni"),
postup_pripravy = None,
), []
lek = p.find(f"{{{NS}}}IPLP")
if lek is not None:
return dict(
typ_leku = "IPLP",
lek_kod = None,
atc = None,
nazev = t(lek, "Nazev"),
forma = t(lek, "Forma"),
sila = None,
cesta_podani = t(lek, "CestaPodani"),
baleni = None,
postup_pripravy = t(lek, "PostupPripravy"),
), parsuj_slozky_predpis(lek)
lek = p.find(f"{{{NS}}}INN")
if lek is not None:
return dict(
typ_leku = "INN",
lek_kod = None,
atc = None,
nazev = t(lek, "Nazev"),
forma = t(lek, "Forma"),
sila = t(lek, "Sila"),
cesta_podani = t(lek, "CestaPodani"),
baleni = t(lek, "Baleni"),
postup_pripravy = None,
), []
return dict(typ_leku=None, lek_kod=None, atc=None, nazev=None,
forma=None, sila=None, cesta_podani=None,
baleni=None, postup_pripravy=None), []
def parsuj_lek_vydej(v):
"""Vraci (lek_fields dict, slozky list).
Typ leku: HVLPReg / HVLPNereg / IPLP — vzdy jen jeden.
"""
for typ in ("HVLPReg", "HVLPNereg"):
lek = v.find(f"{{{NS}}}{typ}")
if lek is not None:
return dict(
typ_leku = typ,
lek_kod = t(lek, "Kod"),
atc = t(lek, "ATC"),
nazev = t(lek, "Nazev"),
forma = t(lek, "Forma"),
sila = t(lek, "Sila"),
cesta_podani = t(lek, "CestaPodani"),
postup_pripravy = None,
), []
lek = v.find(f"{{{NS}}}IPLP")
if lek is not None:
return dict(
typ_leku = "IPLP",
lek_kod = t(lek, "KodVZP"),
atc = None,
nazev = t(lek, "Nazev"),
forma = None,
sila = None,
cesta_podani = t(lek, "CestaPodani"),
postup_pripravy = t(lek, "PostupPripravy"),
), parsuj_slozky_vydej(lek)
return dict(typ_leku=None, lek_kod=None, atc=None, nazev=None,
forma=None, sila=None, cesta_podani=None,
postup_pripravy=None), []
# ── parsovani XML ─────────────────────────────────────────────────────────────
def parsuj_xml(xml_soubor):
tree = ET.parse(xml_soubor)
root = tree.getroot()
odpoved = root[0][0] # Envelope > Body > NacistLekovyZaznamOdpoved
# Doklad prvni, Zprava druha — presne dle XSD sequence
doklad = odpoved.find(f"{{{NS}}}Doklad")
zpr = odpoved.find(f"{{{NS}}}Zprava")
# ── Zprava ───────────────────────────────────────────────────────────────
zprava = dict(
id_zpravy = t(zpr, "ID_Zpravy"),
verze = t(zpr, "Verze"),
odeslano = ts(t(zpr, "Odeslano")),
aplikace = t(zpr, "Aplikace"),
id_podani = t(zpr, "ID_Podani"),
prijato = ts(t(zpr, "Prijato")),
)
# ── Pacient ───────────────────────────────────────────────────────────────
pac = doklad.find(f"{{{NS}}}Pacient")
jmeno = pac.find(f"{{{NS}}}Jmeno")
zprava["pacient_prijmeni"] = t(jmeno, "Prijmeni") if jmeno is not None else None
zprava["pacient_jmena"] = t(jmeno, "Jmena") if jmeno is not None else None
zprava["pacient_datum_narozeni"] = datum(t(pac, "DatumNarozeni"))
# ── Predpisy ──────────────────────────────────────────────────────────────
predpisy = [] # kazda polozka: (row_dict, slozky_list)
predpis_seznam = doklad.find(f"{{{NS}}}PredpisSeznam")
if predpis_seznam is not None:
for p in predpis_seznam.findall(f"{{{NS}}}Predpis"):
row = dict(
id_lp_predpis = t(p, "ID_LP_Predpis"),
kod_predepisujiciho = t(p, "KodPredepisujiciho"),
datum_vystaveni = datum(t(p, "DatumVystaveni")),
mnozstvi = t(p, "Mnozstvi"),
navod = t(p, "Navod"),
opakovani = t(p, "Opakovani"),
modry_pruh = t(p, "ModryPruh"),
)
lek_fields, slozky = parsuj_lek_predpis(p)
row.update(lek_fields)
predpisy.append((row, slozky))
# ── Vydeji ────────────────────────────────────────────────────────────────
vydeji = [] # kazda polozka: (row_dict, slozky_list)
vydej_seznam = doklad.find(f"{{{NS}}}VydejSeznam")
if vydej_seznam is not None:
for v in vydej_seznam.findall(f"{{{NS}}}Vydej"):
row = dict(
id_lp_vydej = t(v, "ID_LP_Vydej"),
id_lp_predpis = t(v, "ID_LP_Predpis"),
kod_vydavajiciho = t(v, "KodVydavajiciho"),
datum_vydeje = datum(t(v, "DatumVydeje")),
mnozstvi = t(v, "Mnozstvi"),
navod = t(v, "Navod"),
exspirace = datum(t(v, "Exspirace")),
sarze = t(v, "Sarze"),
seriove_cislo = t(v, "SerioveCislo"),
pozn = t(v, "Pozn"),
)
lek_fields, slozky = parsuj_lek_vydej(v)
row.update(lek_fields)
vydeji.append((row, slozky))
return zprava, predpisy, vydeji
# ── ulozeni do DB ─────────────────────────────────────────────────────────────
def _najdi_id(cur, tabulka, sloupec, hodnota):
"""Pomocna funkce — vrati id radku dle unikatniho sloupce."""
cur.execute(f"SELECT id FROM {tabulka} WHERE {sloupec} = %s", (hodnota,))
row = cur.fetchone()
return row["id"] if row else None
def uloz(conn, zprava, predpisy, vydeji):
iplp_predpisu = 0
iplp_vydejuu = 0
with conn.cursor() as cur:
# ── zprava ────────────────────────────────────────────────────────────
cur.execute("""
INSERT INTO zprava
(id_zpravy, verze, odeslano, aplikace, id_podani, prijato,
pacient_prijmeni, pacient_jmena, pacient_datum_narozeni)
VALUES
(%(id_zpravy)s, %(verze)s, %(odeslano)s, %(aplikace)s,
%(id_podani)s, %(prijato)s,
%(pacient_prijmeni)s, %(pacient_jmena)s, %(pacient_datum_narozeni)s)
ON DUPLICATE KEY UPDATE
prijato = VALUES(prijato),
stazeno = CURRENT_TIMESTAMP
""", zprava)
zprava_id = _najdi_id(cur, "zprava", "id_zpravy", zprava["id_zpravy"])
print(f" zprava id={zprava_id} ({zprava['id_zpravy']})")
# ── predpisy + jejich slozky ───────────────────────────────────────────
vlozeno_p = 0
vlozeno_ps = 0
for row, slozky in predpisy:
row["zprava_id"] = zprava_id
cur.execute("""
INSERT IGNORE INTO predpis
(zprava_id, id_lp_predpis, kod_predepisujiciho,
datum_vystaveni, mnozstvi, navod, opakovani, modry_pruh,
typ_leku, lek_kod, atc, nazev, forma, sila,
cesta_podani, baleni, postup_pripravy)
VALUES
(%(zprava_id)s, %(id_lp_predpis)s, %(kod_predepisujiciho)s,
%(datum_vystaveni)s, %(mnozstvi)s, %(navod)s,
%(opakovani)s, %(modry_pruh)s,
%(typ_leku)s, %(lek_kod)s, %(atc)s, %(nazev)s, %(forma)s,
%(sila)s, %(cesta_podani)s, %(baleni)s, %(postup_pripravy)s)
""", row)
vlozeno_p += cur.rowcount
if slozky:
iplp_predpisu += 1
predpis_db_id = cur.lastrowid or _najdi_id(cur, "predpis", "id_lp_predpis", row["id_lp_predpis"])
for s in slozky:
s["predpis_id"] = predpis_db_id
cur.execute("""
INSERT INTO predpis_slozka
(predpis_id, mnozstvi, jednotka, nazev, surovina, hvlp_reg)
VALUES
(%(predpis_id)s, %(mnozstvi)s, %(jednotka)s,
%(nazev)s, %(surovina)s, %(hvlp_reg)s)
""", s)
vlozeno_ps += 1
print(f" predpisy: {vlozeno_p} novych (celkem {len(predpisy)})")
print(f" predpis_slozka: {vlozeno_ps} slozek z {iplp_predpisu} IPLP predpisu")
# ── vydeji + jejich slozky ────────────────────────────────────────────
vlozeno_v = 0
vlozeno_vs = 0
for row, slozky in vydeji:
row["zprava_id"] = zprava_id
cur.execute("""
INSERT IGNORE INTO vydej
(zprava_id, id_lp_vydej, id_lp_predpis, kod_vydavajiciho,
datum_vydeje, mnozstvi, navod, exspirace, sarze,
seriove_cislo, pozn,
typ_leku, lek_kod, atc, nazev, forma, sila,
cesta_podani, postup_pripravy)
VALUES
(%(zprava_id)s, %(id_lp_vydej)s, %(id_lp_predpis)s, %(kod_vydavajiciho)s,
%(datum_vydeje)s, %(mnozstvi)s, %(navod)s, %(exspirace)s, %(sarze)s,
%(seriove_cislo)s, %(pozn)s,
%(typ_leku)s, %(lek_kod)s, %(atc)s, %(nazev)s, %(forma)s,
%(sila)s, %(cesta_podani)s, %(postup_pripravy)s)
""", row)
vlozeno_v += cur.rowcount
if slozky:
iplp_vydejuu += 1
vydej_db_id = cur.lastrowid or _najdi_id(cur, "vydej", "id_lp_vydej", row["id_lp_vydej"])
for s in slozky:
s["vydej_id"] = vydej_db_id
cur.execute("""
INSERT INTO vydej_slozka
(vydej_id, mnozstvi, jednotka, nazev,
hrazeno_zp, surovina, hvlp_reg)
VALUES
(%(vydej_id)s, %(mnozstvi)s, %(jednotka)s, %(nazev)s,
%(hrazeno_zp)s, %(surovina)s, %(hvlp_reg)s)
""", s)
vlozeno_vs += 1
print(f" vydeji: {vlozeno_v} novych (celkem {len(vydeji)})")
print(f" vydej_slozka: {vlozeno_vs} slozek z {iplp_vydejuu} IPLP vydejuu")
conn.commit()
# ── main ──────────────────────────────────────────────────────────────────────
def main():
xml = Path(sys.argv[1]) if len(sys.argv) > 1 else XML_SOUBOR
print(f"XML: {xml} ({xml.stat().st_size // 1024} KB)")
print("Parsovani XML ...")
zprava, predpisy, vydeji = parsuj_xml(xml)
print(f" -> {len(predpisy)} predpisu, {len(vydeji)} vydejuu")
print("Pripojeni k MySQL ...")
conn = pymysql.connect(**DB)
try:
vytvor_schema(conn)
print("Ukladani ...")
uloz(conn, zprava, predpisy, vydeji)
print("Hotovo OK")
finally:
conn.close()
if __name__ == "__main__":
main()