janssen/Feasibility/77242113UCO2001/store_cda_batch_v1.2.md

store_cda_batch_v1.2.py

Verze: 1.2 · Datum: 2026-06-11

Dávkové uložení binárek CDA (PDF) do Mongo feasibility.investigators → cda.data_*. Zdroj = .msg soubory na Toweru (/mnt/user/JNJEMAILS), stažené přes SFTP (paramiko), příloha vytažena extract_msg.

Princip

• MAPPING = explicitní seznam (investigator_id, msg_filename, attachment_filename, label) — žádné hádání za běhu.
• CDA chodí od 3 asistentek z CTA: Wittenbergerová (LWittenb), Hrabalová (LHrabalo), Vojčová (LVojcova).

Co zapisuje

cda.data_base64, cda.data_sha256, cda.data_filename, cda.data_mime, cda.data_size, cda.data_stored_at, cda.data_source_msg; doplní cda.soubor.

Spuštění

python store_cda_batch_v1.2.py            # dry-run / náhled
python store_cda_batch_v1.2.py --apply    # zápis do Mongo

venv má paramiko + extract_msg + pymongo.

Historie

• v1.2 — DÁVKA 5 (11JUN2026): Mudr Robert (Nemocnice Milosrdných sester sv. Karla Boromejského, od Vojčové). Krok 4 → 5.
• v1.1 — DÁVKA 4 (11JUN2026): Konečný Michal, Baláž Jozef.
• v1.0 — DÁVKY 1–3 (09–10JUN2026): Hlavatý, Fedurco, Tichý, Falc, Pešta, Jungwirthová, Matouš, Mihálkanin, Krížová, Gregar, Ďurina, Horváth. (Lukáč zvlášť přes store_cda_to_mongo.)